Scooby Doo si Piratul este partea a doua (intitulata original Neptune's Nest [Cuibuul lui Neptun]) dintr-o serie de jocuri de aventura si intuitie cu Scooby Doo.
In acest joc Scooby impreuna cu partenerul Shaggy trebuie sa rezolve misterul unui pirat fantoma, ca de obicei, intr-o aventura plina de peripetii si pericole.
Jocul incepe dupa o scurta prezentare la inceput. Se folosesc sagetile de la tastatura pentru deplasare, tasta Space pentru colectare obiecte si actiune asupra lor (unde e nevoie), tasta 'S' pentru a salva jocul, 'L' pt. incarcare joc salvat, 'T' schimbare obiecte adunate, 'P' Pauza (Vedeti si instructiunile).
Pentru a trece fiecare nivel, gasiti si colectati toate obiectele ce trebuiesc adunate si pe care le folositi pt. a deschide drumul spre noul nivel.
De exemplu, la inceput luati racul din partea de jos (cu Space), mergeti in dreapta, luati si batul (nu e degeaba acolo), schimbati cu 'T' pe racul luat la inceput (apare in colt dreapta-sus), mergeti la rechin si apasati Space, dupa ce pleaca luati ancora, mergeti la lantul de sus si cu Space se deschid gratiile, apoi treceti la urmatorul nivel si va descurcati :).